長時間運動搭配服用魚油可以顯著降低會導致動脈硬化的體脂肪，而動脈硬化正是心臟病的主因。血液中的脂肪是動脈粥樣硬化或動脈部分阻塞的主要原因。
一項研究發現，長時間做有氧運動的人，會擁有能夠快速分解並降低稱為三酸甘油酯這種脂肪的肌肉細胞。服用魚油補充品也可以更大程度地降低三酸甘油酯。
研究人員針對健康活躍的男性，測量他們在吃了高脂餐後血液中的三酸甘油酯濃度。其中第一組會先運動再進食，第二組則是先服用四克魚油補充品再進食，第三組則在運動並服用魚油補充品之後才進食；對照組則僅進食高脂餐。
研究發現，在吃高脂肪餐之前，服用魚油補充品的男性，三酸甘油酯的濃度下降38%。另一組運動並服用魚油補充品之後才進食的，其三酸甘油酯濃度下降了50%。
在一項類似的研究中，魚油補充品搭配規律的運動，可改善身體體質並且減低心臟病的風險因素。研究將超重並且有各種心臟病風險因素的參與者分成三組：服用魚油（大約每天攝取1.9克的ω-3脂肪酸）、服用魚油搭配運動、或服用安慰劑（葵花油），運動組每週三天各走路45分鐘。在開始前、第6周、與第12週分別測量心臟病風險因素和身體組成。服用魚油組的三酸甘油酯顯著降低、HDL膽固醇增加，並且改善了動脈血管舒張（血流）；可以看出魚油和運動都分別減少體脂肪。
這項研究顯示，對於針對改善體質和降低罹患心血管疾病風險的健身課程而言，增加ω-3脂肪酸的攝取量是很有益處的。