研究人員在加州大學戴維斯分校病理與實驗室醫學系副主任Yu-Jui Yvonne Wan教授的帶領下，研究人員利用法尼基X受體或FXR缺陷小鼠模型進行研究。FXR也被稱為膽汁酸受體（BAR），在膽汁酸，葡萄糖和脂質的穩態中起重要作用。肝癌或肝硬化患者肝臟不可逆的瘢痕形成通常具有較低的FXR水平，因此，該小鼠模型在了解飲食和炎症對肝臟疾病發展的影響方面的重要性。
FXR缺陷小鼠以及野生小鼠在10個月內均服用西方飲食或配對對照飲食。還包括廣譜抗生素，以分析其對腸道微生物群的影響，隨後分析其對肝臟炎症的影響。
Wan解釋說：“因為肝臟從腸中獲得了70％的血液供應，所以重要的是了解腸道如何有助於肝臟疾病的發展。” “我們的數據顯示，飲食，性別和不同的抗生素治療改變腸道微生物群以及膽汁酸分佈，對肝臟炎症有不同的影響。
研究結束後，研究人員發現FXR缺乏症與西方飲食攝入量之間存在相似之處。
西方飲食餵養的野生小鼠和對照飲食餵養的FXR缺陷小鼠在其肝臟中累積脂肪，這在雄性小鼠中更為嚴重。另外，已經給予氨芐青黴素，萬古黴素，新黴素和甲硝唑的雞尾酒的野生小鼠顯示出很少的肝臟炎症徵象。然而，對於餵食西方飲食的FXR缺陷型小鼠來說，這一點也是不能說的。
研究人員發現，即使在給予廣譜抗生素後，促炎的變形桿菌和類桿菌也繼續存在。相反，給予孕激素抗生素的西方飲食餵養的小鼠經歷了肝臟炎症的減輕。
“腸道與肝臟健康有關聯。很明顯，微生物不平衡和膽汁酸合成失調是不可分割的，它們通過腸肝軸線共同促進肝臟炎症，“Wan說。“我們的研究結果表明，益生菌和FXR激動劑有望預防和治療肝臟炎症和進展為晚期肝臟疾病如癌症。”（相關：健康的消炎腸道細菌實際上是避免癌症開始的關鍵）
因此，西方飲食對肝臟的不利影響可能部分在於飲食中減少抗炎，友好腸道細菌的量，同時鼓勵促炎腸細菌的生長。
事實上，2013年的一項研究發現，友好腸細菌保護肝臟的一種方法是通過阻止脂多醣進入腸道。因此，由於脂多醣是與肥胖有關的細菌毒素，所以肝臟緩解了刺激和壓力。
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