自噬和線粒體自噬是有缺陷的細胞和線粒體的選擇性降解

減少，回收，更新
在宏觀層面上，維護人類健康需要密集和持續的清理工作。在微觀層面上，每個小區內都有相同的原則。
生命過程必不可少的蛋白質必須在完成其指定的任務後退化，從提供結構支持到細胞和組織，以保護身體免受致病性外來入侵者的侵害。如果身體的家政操作停滯或效率低下，結果可能是災難性的。
先前的研究揭示了蛋白質生產與降解之間的不平衡如何導致與幾種致死性神經退行性疾​​病（包括肌萎縮性側索硬化症（ALS），帕金森氏病和阿爾茨海默氏病）有關的蛋白質產物的積累。
在自噬過程中，不需要的細胞成分被分離出來，並在專門的雙膜隔室（稱為自噬體）中被隔離。包裝的蛋白質“垃圾”然後與溶酶體融合，細胞器的細​​胞質中的消化酶分解蛋白質組分。當來自降解蛋白質的組成氨基酸成為新蛋白質的原料時，回收完成。

自噬是這個過程的總稱，包括所有的細胞器。線粒體自噬是指與線粒體特異性相關的過程。
這裡有一個比喻可以用來理解線粒體自噬的概念。

線粒體是細胞的動力，將燃料轉化為能量。當他們年輕健康的時候，他們非常有效地提供能量很少的廢物（自由基）。隨著年齡的增長或者疲憊，他們的能量產生的效率要低得多，並且會釋放更高水平的自由基。我們可以把這個比喻成汽車的發動機。當汽車是新的，它是非常有效的，並放出少量排放量。隨著汽車使用時間的延長，發動機失去了效率，排放量也大大增加。在某一時刻，檢查發動機指示燈亮起，表示發動機可能需要檢修或完全更換，以使車輛繼續最佳運行。在某些條件下，飲食中的營養素模仿“壓力源”，像卡路里限制一樣。
Zhang J. Autophagy and Mitophagy in Cellular Damage Control. Redox Biol. 2013;1(1):19-23.